• 研究代表者: 柴田 龍弘（独立行政法人国立がん研究センター がんゲノミクス研究分野 分野長)
• 連携研究者: 高橋 隆（名古屋大学大学院医学研究科 分子腫瘍学分野 教授）

研究室ホームページ http://www.ncc.go.jp/jp/nccri/divisions/19genom/index.html

ENCODE計画から我々のゲノムの75%が転写されていることが明らかになった。その多くはタンパク質に翻訳されないlong non-coding RNA (lncRNA)として機能し、転写・エピゲノム制御を介し、がんの発生・進展に重要と推定されるが、その全貌については未解明である。近年一分子解読技術を含めた第3世代長鎖シークエンスにより未知のlncRNAの全長cDNAの同定が可能となった。本研究では、こうした新技術導入と新たな解析手法を開発することで、肝臓がんを例として、1. lncRNAの全長cDNAレパートリーの同定、2. 全ゲノム変異解読データとの統合解析による個別化診断に向けた新たながん関連lncRNAの発見、3. ゲノム全体におけるlncRNA発現とがんゲノム変異頻度・染色体構造異常部位との相関や特徴に関するシステム的解析、を目的とする。